Inicialmente conhecido por Colônia Rondinha, mais tarde passou a ser chamada Santa Lúcia. Em 29/12/1944, quando foi assinado no Estado o Decreto-Lei 72, que fixava a organização administrativa e judiciária do RS, o distrito de Santa Lúcia passou a denominar-se Caibaté, por influência do IBGE. De origem guarani, o nome significa mato alto com muitas frutas. É conhecida como a cidade Coração das Missões.
Caibaté está localizada a 487 Km da capital Porto Alegre.